Joshua Jackson 11 Haziran 1978'de Vancouver'da doğdu. Ailesi İrlanda'nın Ballyfermot şehrinden göç etmiştir. Küçük yaşta ailesi ile Kaliforniya'da yaşamış, daha sonra annesi ve kız kardeşiyle Vancouver'a taşınmıştır. Ideal Mini School ve Kitsilano Lisesi'nde eğitim görmüş ve Ryan Reynolds ile aynı liseye gitmiştir.
Jackson'ın oyunculuk kariyeri 1991 yılında "Crooked Hearts" filmindeki küçük bir rolle başladı. 1992-1996 yılları arasında "The Mighty Ducks" serisinde Charlie Conway rolüyle tanındı. 1998-2003 yılları arasında yayınlanan "Dawson's Creek" dizisindeki Pacey Witter rolüyle büyük çıkış yakaladı. Bu dönemde "Cruel Intentions", "The Skulls", ve "Ocean's Eleven" gibi filmlerde de rol aldı. 2005 yılında Londra West End'de Patrick Stewart ile "A Life in the Theatre" oyununda tiyatro sahnesine çıktı. 2008-2013 yılları arasında J.J. Abrams'ın bilimkurgu dizisi "Fringe"de Peter Bishop rolünü üstlendi. 2010 yılında Kanada yapımı "One Week" filmindeki performansıyla En İyi Erkek Oyuncu dalında Genie Ödülü kazandı. 2014-2018 yılları arasında "The Affair" dizisinde Cole Lockhart karakterini canlandırdı. Ayrıca "When They See Us" ve "Little Fires Everywhere" gibi mini dizilerde çeşitli roller üstlendi.
Son yıllarda, 2021 yılında "Dr. Death" dizisinde Dr. Christopher Duntsch karakterini canlandırarak eleştirmenlerden övgü aldı ve 2022 Critics' Choice Televizyon Ödülleri'nde En İyi Erkek Oyuncu adaylığı kazandı. 2023'te Lizzy Caplan ile birlikte "Fatal Attraction" dizisinde başrolleri paylaştıktan sonra Doctor Odyssey serisinde ise Dr. Max Bankman karakterine hayat verdi.