İşte burası karışık. Fark ettiyseniz tüm oyunun konusu karışık ve kimin elinin kimin cebinde olduğunu söylemek zor. The Boss ana kötü olarak biliniyor. Sovyet Rusya'ya sığınmasından ve nükleer silahlarla oynamasından bunu anlayabilirsiniz. Ama sonradan ortaya çıkıyor ki aslında The Boss, Amerika'ya sadıkmış. Aynı zamanda The Patriots'a karşıymış. Ama bunlarla da kalmıyor Boss bir kez daha taraf değiştiriyor. O kısmın filmde nasıl gösterileceğini biz de bilemiyoruz.
Tabii Metal Gear da bir kötü karakter olarak geçiyor. Ama buna karakter diyemeyiz; çünkü esasen yapay zekaya sahip nükleer bir silah. Dedikodulara göre filmde The Boss ve -filme adını veren- Metal Gear özellikle kullanılacak.