Entre dos Aguas, iki kardeşin hikayesini konu ediyor. Isra ve Cheito, yolları ayrılan iki kardeştir. Isra uyuşturucu ticareti yapmaktan dolayı cezaevine gönderilirken, Cheito da görev gereği uzun bir yolculuğa çıkar. Cezası bitip hapisten çıkan Isra ve görevini artık bitiren Cheito soluğu evlerinde, San Fernando’da alır. Bu sayede kardeşler yıllar sonra yeniden bir araya gelir. Ancak onların evlerine geri dönmeleri, babalarının vahşi ölümünü hatırlamalarına neden olur. Isra ve Cheito, bir yandan hayatlarına devam etmeye çalışırken bir yandan da birbirlerini affedip yeniden aralarında bir bağ kurmaya çalışır.