Sydney Bristow üniversitenin ilk yıllarında CIA'in gizli kolu olduğunu düşündüğü SD-6 isimli bir örgütte çalışmaya başlar. Bristow yaşanan büyük bir trajedi sonrası, SD-6'nın aslında devlet düşmanı bir örgüt olduğunu öğrenir. Bu örgütten intikam almaya yemin eden Sydney CIA ile çalışmaya başlar ve çift yönlü ajanlık hayatına başlar.