Dark Matter, bir gece Chicago sokaklarında evine yürürken hayatının alternatif bir versiyonuna kaçırılan fizikçi, profesör ve aile babası Jason Dessen'in hikayesini konu ediyor. Jason, yaşayabileceği hayatların akıl almaz manzarasının ortasında kendi gerçekliğine dönmeye çalışırken, yaşadığı şaşkınlık hızla kabusa dönüşür. Bu gerçekler labirentinde, gerçek ailesine geri dönmek ve onları akla gelebilecek en korkunç, yenilmez düşmandan kurtarmak için yürek parçalayıcı bir yolculuğa çıkar.