Göremediğimiz Tüm Işıklar, görme engelli bir Fransız genç olan Marie-Laure ve bir Alman askeri olan Werner'in hikayesini konu ediyor. Marie-Laure, Paris'te, babasının çalıştığı müzenin yakınlarında yaşamaktadır. Nazilerin işgali sırasında baba kız, Paris’ten kaçmak zorunda kalır. Genç Alman Werner ise bildiği her şeyi kendi kendine öğrenmiş yetim bir radyo uzmanıdır. Werner, tüm bilgisini Fransız Direnişini yenmek için kullanmak üzere askere alınır. İkisinin yolu, işgal altındaki Fransa'da 2. Dünya Savaşı'nın yıkımından sağ kurtulmaya çalışırken kesişir.